In dieser Staffel müssen sich Walt und Jesse sowohl mit persönlichen als auch beruflichen Niederschlägen auseinandersetzen. Zudem wächst die Spannung, als Walt sich einer Pattsituation mit seinem Arbeitgeber Gus gegenübersieht, bei der keine der beiden Seiten bereit oder in der Lage ist, nachzugeben. Walt muss sich außerdem auf die veränderte Beziehung zu Skyler (Anna Gunn) einstellen...
Nach einer spannenden dritten Staffel, in der Walt und Jesse um ihr Leben kämpften, warten die beiden besorgt darauf, was Gus als Nächstes tun wird.
Während Walt seine Verteidigung gegen Gus vorbereitet, bewältigt Jesse den Druck, indem er seine Freundschaft zu Badger und Skinny Pete wieder aufnimmt.
Während sich Walt um Gus' Einmischung und Jesses zunehmend labilen Zustand sorgt, erhöht Skyler den Druck, um das zu bekommen, was sie will.
Während Skyler eine Geschichte ausheckt, um den Reichtum der Familie zu rechtfertigen, befürchtet Walt, dass Hank die Ermittlungen wieder aufgenommen hat.
Jesse begleitet Mike auf eine gefährliche Tour, bei der sie mehrere Taschen voller Geld einsacken. Währenddessen sorgt sich Walt und denkt sofort an das Schlimmste.
Als sie den Verdacht hat, dass Walt ihr nicht die Wahrheit sagt, beginnt Skyler sich zu distanzieren. Währenddessen stellt sich Jesse bei Mike und Gus unter Beweis.
Als Walt das Auto für seinen Sohn zurückgeben soll, konfrontiert er Skyler mit ihrem neuen Geldwäsche-Unternehmen.
Hank findet Beweise dafür, dass Gus der Kopf des Crystal-Meth-Handels in Albuquerque ist, und Walt ist um sein und Jesses Leben besorgt.
Während Walt Hanks Versuch untergräbt, der Meth-Szene von Albuquerque auf den Zahn zu fühlen, erwägt Gus ein Geschäft mit dem mexikanischen Kartell.
Der arg zugerichtete Walt versucht, sich von dem Kampf zu erholen. Gus schleppt Jesse mit nach Mexiko, um den Deal mit dem Kartell zu besiegeln.
Während Skyler Ted bedrängt, ihr Geld anzunehmen, um seine Steuern zu zahlen, besteht Gus darauf, dass Jesse die Arbeit im Labor allein wieder aufnimmt.
Walt schickt seine Familie unter DEA-Schutz zu Hank, während er selbst zu Hause bleibt und auf das wartet, was nun auf ihn zukommt.
Als Jesse und Walt Gus nicht wie geplant aus dem Weg schaffen können, müssen sie ganz schnell ihre Spuren verwischen, um nicht selbst einem Mord zum Opfer zu fallen.